| 校長 | 坂元幸子 藤沢バプテスト教会牧師 |
| 教務主任 | 内藤淳一郎 茗荷谷キリスト教会協力牧師 |
| 学生主任 | 松村誠一 品川バプテスト教会牧師 |
| 教会音楽科主任 | 十時節子 日本バプテスト東京第一教会 |
| 事務長 | 川口通治 篠崎キリスト教会牧師 |
| 事務長補佐 | 村中範光 品川バプテスト教会 |
| 事務 | 林雄植 渋谷バプテスト教会 |
| 事務 | 小牧由香 常盤台バプテスト教会 |
理事会（2016年11月現在）
| 理事長 | 奥田 稔 日本バプテスト前橋教会牧師 |
| 東京連合選出理事 | 鈴木知子 花野井バプテスト教会 |
| 東京連合選出理事 | 富田愛世 日本バプテスト東京第一教会牧師 |
| 東京連合選出理事 | 松田俊介(予定） 日本バプテストキリスト教目白が丘教会 |
| 北関東連合選出理事 | 永町友恵 大宮バプテスト教会牧師 |
| 北関東連合選出理事 | 岡田利男 日本バプテスト浦和キリスト教会 |
| 神奈川連合選出理事 | 神山 武 横浜JOYバプテスト教会伝道師 |
| 神奈川連合選出理事 | 鉄井三千夫 横浜山手バプテスト教会牧師 |
| 監事 | 川勝高宏 相模中央キリスト教会 |
| 校長 | 坂元幸子 藤沢バプテスト教会牧師 |
| 理事会推薦理事 | 秋山信夫 上尾キリスト教会牧師 |
| 理事会推薦理事 | 藤井秀一 花小金井バプテスト教会牧師 |